Die Forschung am Zentrum beschäftigt sich mit Schlüsselproteinen. Dies sind Proteine, die wichtige physiologische Aufgaben übernehmen und daher bei Fehlfunktion häufig zu Krankheiten führen. Die Ergebnisse liefern Hinweise für die Diagnose von Erkrankungen und neue Therapieansätze.

Wichtige Gesichtspunkte bei der Untersuchung der Proteine sind hierbei deren Faltung und Mobiliät sowie ihre Modifizierung und ihr Abbau. Das Verständnis des Wechselspiels zwischen Proteinen und kleinen Liganden ist wesentlich, um zu verstehen, wie die Funktion von Signalproteinen, z.B. Rezeptoren, reguliert wird und wie diese aktiviert werden. Ebenso grundlegend sind die Interaktionen zwischen Proteinen und Nukleinsäuren für die Signalwege im Kern und die Nutzung und Aufrechterhaltung der genetischen Information.

Vier Forschungsfelder stehen daher im Mittelpunkt des Zentrums: (1) Protein-Struktur und Funktion, (2) Proteine und zelluläre Signalwege, (3) Nukleinsäure-bindende Proteine und (4) Proteine in Zell-Zell Interaktionen und Motilität. Obwohl  jede Gruppe eigene Forschungsschwerpunkte besitzt, werden dennoch viele Projekte in Zusammenarbeit durchgeführt und ermöglichen damit eine interdisziplinäre Herangehensweise.